MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 27083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	GCC	3	9	6	14	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
2	NC_012792	CGC	2	6	15	20	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
3	NC_012792	GCT	2	6	32	37	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819986
4	NC_012792	GCC	2	6	55	60	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
5	NC_012792	GCG	2	6	96	101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819986
6	NC_012792	CCA	2	6	119	124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819986
7	NC_012792	AGGCC	2	10	209	218	20 %	0 %	40 %	40 %	239819986
8	NC_012792	GCA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819986
9	NC_012792	CCA	2	6	327	332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819986
10	NC_012792	T	6	6	356	361	0 %	100 %	0 %	0 %	239819986
11	NC_012792	GTC	2	6	481	486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819986
12	NC_012792	GCC	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
13	NC_012792	GCG	2	6	530	535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819986
14	NC_012792	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819986
15	NC_012792	CGC	2	6	633	638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
16	NC_012792	GAA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819986
17	NC_012792	ATCC	2	8	688	695	25 %	25 %	0 %	50 %	239819986
18	NC_012792	CGCAGC	2	12	706	717	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239819986
19	NC_012792	TCGT	2	8	718	725	0 %	50 %	25 %	25 %	239819986
20	NC_012792	AGC	2	6	751	756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819986
21	NC_012792	AGC	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819986
22	NC_012792	CGC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
23	NC_012792	CAG	2	6	861	866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819986
24	NC_012792	CGA	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819987
25	NC_012792	GC	3	6	1066	1071	0 %	0 %	50 %	50 %	239819987
26	NC_012792	TGG	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819987
27	NC_012792	GGT	2	6	1081	1086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819987
28	NC_012792	CGG	2	6	1137	1142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819987
29	NC_012792	AAG	2	6	1157	1162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819987
30	NC_012792	TGC	3	9	1188	1196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819987
31	NC_012792	GC	3	6	1230	1235	0 %	0 %	50 %	50 %	239819987
32	NC_012792	GCT	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819987
33	NC_012792	GC	3	6	1250	1255	0 %	0 %	50 %	50 %	239819987
34	NC_012792	GAC	2	6	1337	1342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819987
35	NC_012792	ACCT	2	8	1352	1359	25 %	25 %	0 %	50 %	239819987
36	NC_012792	TGC	2	6	1368	1373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819987
37	NC_012792	GCCG	2	8	1382	1389	0 %	0 %	50 %	50 %	239819987
38	NC_012792	CCTC	2	8	1431	1438	0 %	25 %	0 %	75 %	239819987
39	NC_012792	CG	3	6	1450	1455	0 %	0 %	50 %	50 %	239819987
40	NC_012792	CGGCA	2	10	1537	1546	20 %	0 %	40 %	40 %	239819987
41	NC_012792	GCA	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819987
42	NC_012792	GCC	2	6	1634	1639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819987
43	NC_012792	GGC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819987
44	NC_012792	GC	3	6	1645	1650	0 %	0 %	50 %	50 %	239819987
45	NC_012792	TGGCCG	2	12	1713	1724	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239819987
46	NC_012792	GCA	2	6	1827	1832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819987
47	NC_012792	GGCG	2	8	1903	1910	0 %	0 %	75 %	25 %	239819987
48	NC_012792	CCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819988
49	NC_012792	TGAA	2	8	1985	1992	50 %	25 %	25 %	0 %	239819988
50	NC_012792	GCG	2	6	2002	2007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819988
51	NC_012792	GAT	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819988
52	NC_012792	TGG	2	6	2064	2069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819988
53	NC_012792	CGA	2	6	2107	2112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819988
54	NC_012792	GCCAG	2	10	2191	2200	20 %	0 %	40 %	40 %	239819988
55	NC_012792	CGG	2	6	2212	2217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819988
56	NC_012792	GTC	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819988
57	NC_012792	GCG	2	6	2299	2304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819988
58	NC_012792	GTG	3	9	2364	2372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819988
59	NC_012792	GC	3	6	2423	2428	0 %	0 %	50 %	50 %	239819988
60	NC_012792	TGA	2	6	2455	2460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819988
61	NC_012792	GAG	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239819989
62	NC_012792	CG	3	6	2670	2675	0 %	0 %	50 %	50 %	239819989
63	NC_012792	CG	3	6	2681	2686	0 %	0 %	50 %	50 %	239819989
64	NC_012792	GCT	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819989
65	NC_012792	TGA	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819989
66	NC_012792	AGC	3	9	2783	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819989
67	NC_012792	CGC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
68	NC_012792	GCC	3	9	2863	2871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
69	NC_012792	C	6	6	2880	2885	0 %	0 %	0 %	100 %	239819989
70	NC_012792	CG	3	6	2892	2897	0 %	0 %	50 %	50 %	239819989
71	NC_012792	TCG	2	6	2918	2923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819989
72	NC_012792	CGA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819989
73	NC_012792	CCG	2	6	2973	2978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
74	NC_012792	CGG	2	6	3025	3030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819989
75	NC_012792	TTG	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239819989
76	NC_012792	GAAC	2	8	3075	3082	50 %	0 %	25 %	25 %	239819989
77	NC_012792	TGCC	2	8	3117	3124	0 %	25 %	25 %	50 %	239819989
78	NC_012792	GGCC	2	8	3126	3133	0 %	0 %	50 %	50 %	239819989
79	NC_012792	GCGCG	2	10	3166	3175	0 %	0 %	60 %	40 %	239819989
80	NC_012792	CGG	2	6	3193	3198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819989
81	NC_012792	TTC	2	6	3208	3213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239819989
82	NC_012792	CTTGC	2	10	3277	3286	0 %	40 %	20 %	40 %	239819989
83	NC_012792	GCC	2	6	3295	3300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
84	NC_012792	CG	4	8	3349	3356	0 %	0 %	50 %	50 %	239819989
85	NC_012792	CGT	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819989
86	NC_012792	TGG	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819989
87	NC_012792	CGAG	2	8	3426	3433	25 %	0 %	50 %	25 %	239819989
88	NC_012792	GCC	2	6	3511	3516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
89	NC_012792	GAA	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819989
90	NC_012792	CGT	2	6	3552	3557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819989
91	NC_012792	GTG	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819989
92	NC_012792	CGG	2	6	3587	3592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819989
93	NC_012792	GCA	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819989
94	NC_012792	TGT	2	6	3636	3641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239819989
95	NC_012792	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	239819989
96	NC_012792	GGC	2	6	3742	3747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819989
97	NC_012792	TGG	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819989
98	NC_012792	CCA	2	6	3896	3901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819990
99	NC_012792	GCA	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819990
100	NC_012792	GC	3	6	3940	3945	0 %	0 %	50 %	50 %	239819990
101	NC_012792	CG	3	6	4030	4035	0 %	0 %	50 %	50 %	239819990
102	NC_012792	CAC	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819990
103	NC_012792	GACG	2	8	4167	4174	25 %	0 %	50 %	25 %	239819990
104	NC_012792	GGT	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819990
105	NC_012792	CTG	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819990
106	NC_012792	GCG	2	6	4214	4219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819990
107	NC_012792	GC	5	10	4249	4258	0 %	0 %	50 %	50 %	239819990
108	NC_012792	GGCC	2	8	4341	4348	0 %	0 %	50 %	50 %	239819990
109	NC_012792	ACG	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
110	NC_012792	TGCC	2	8	4683	4690	0 %	25 %	25 %	50 %	239819991
111	NC_012792	CG	4	8	4806	4813	0 %	0 %	50 %	50 %	239819991
112	NC_012792	CAG	2	6	4939	4944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
113	NC_012792	CGA	2	6	4953	4958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
114	NC_012792	TCG	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819991
115	NC_012792	CGC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819991
116	NC_012792	CG	3	6	5000	5005	0 %	0 %	50 %	50 %	239819991
117	NC_012792	CGA	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
118	NC_012792	CAC	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819991
119	NC_012792	GC	3	6	5105	5110	0 %	0 %	50 %	50 %	239819991
120	NC_012792	CGG	2	6	5116	5121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819991
121	NC_012792	CCG	2	6	5135	5140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819991
122	NC_012792	TCG	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819991
123	NC_012792	TGG	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819991
124	NC_012792	CG	4	8	5228	5235	0 %	0 %	50 %	50 %	239819991
125	NC_012792	CAG	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
126	NC_012792	GCTG	2	8	5327	5334	0 %	25 %	50 %	25 %	239819991
127	NC_012792	GCG	3	9	5415	5423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819992
128	NC_012792	GC	3	6	5450	5455	0 %	0 %	50 %	50 %	239819992
129	NC_012792	GCC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
130	NC_012792	CGG	2	6	5529	5534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819992
131	NC_012792	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819992
132	NC_012792	GCC	2	6	5603	5608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
133	NC_012792	GC	3	6	5635	5640	0 %	0 %	50 %	50 %	239819992
134	NC_012792	GAA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819992
135	NC_012792	GCC	2	6	5728	5733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
136	NC_012792	TGCG	2	8	5820	5827	0 %	25 %	50 %	25 %	239819992
137	NC_012792	CG	3	6	5835	5840	0 %	0 %	50 %	50 %	239819992
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139	NC_012792	CTT	2	6	5886	5891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239819992
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249	NC_012792	G	6	6	11454	11459	0 %	0 %	100 %	0 %	239819997
250	NC_012792	CGA	2	6	11466	11471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819997
251	NC_012792	GACAGC	2	12	11476	11487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819997
252	NC_012792	TGATGC	9	54	11493	11546	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239819997
253	NC_012792	GGATGC	11	66	11547	11612	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239819997
254	NC_012792	GGACGC	3	18	11613	11630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239819997
255	NC_012792	GGATGC	2	12	11631	11642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239819997
256	NC_012792	GGACGC	4	24	11643	11666	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239819997
257	NC_012792	GGATGC	12	72	11667	11738	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239819997
258	NC_012792	GATGCC	2	12	11776	11787	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239819997
259	NC_012792	GATGCC	4	24	11794	11817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239819997
260	NC_012792	GCCGAT	3	18	11821	11838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239819997
261	NC_012792	CGGATG	4	24	11846	11869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239819997
262	NC_012792	CCGATG	2	12	11870	11881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239819997
263	NC_012792	CCGACG	5	30	11882	11911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239819997
264	NC_012792	GATGCC	5	30	11914	11943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239819997
265	NC_012792	GCAGAC	3	18	11947	11964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819997
266	NC_012792	CCT	2	6	11973	11978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239819997
267	NC_012792	CGG	2	6	12000	12005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
268	NC_012792	CGAC	2	8	12017	12024	25 %	0 %	25 %	50 %	239819997
269	NC_012792	CCTGGG	2	12	12030	12041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239819997
270	NC_012792	CGAC	2	8	12080	12087	25 %	0 %	25 %	50 %	239819997
271	NC_012792	GAG	2	6	12121	12126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239819997
272	NC_012792	CAT	2	6	12213	12218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239819997
273	NC_012792	CTG	2	6	12226	12231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
274	NC_012792	GCG	2	6	12332	12337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
275	NC_012792	CGG	2	6	12387	12392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
276	NC_012792	CGT	2	6	12393	12398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
277	NC_012792	CTG	2	6	12436	12441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
278	NC_012792	GAA	2	6	12457	12462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819997
279	NC_012792	GGC	2	6	12472	12477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
280	NC_012792	CTG	2	6	12508	12513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
281	NC_012792	CGG	2	6	12531	12536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
282	NC_012792	CTG	2	6	12538	12543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
283	NC_012792	CGA	2	6	12558	12563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819997
284	NC_012792	CGT	2	6	12567	12572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
285	NC_012792	CGG	2	6	12573	12578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
286	NC_012792	CCT	2	6	12579	12584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239819997
287	NC_012792	GGC	2	6	12604	12609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
288	NC_012792	CGG	2	6	12615	12620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
289	NC_012792	CTG	2	6	12640	12645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
290	NC_012792	GGC	2	6	12646	12651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
291	NC_012792	CGG	2	6	12657	12662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
292	NC_012792	CGG	2	6	12675	12680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
293	NC_012792	CTG	2	6	12682	12687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
294	NC_012792	GGC	2	6	12688	12693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819997
295	NC_012792	CTG	2	6	12712	12717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
296	NC_012792	GTG	2	6	12790	12795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819997
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298	NC_012792	CTG	2	6	12859	12864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819997
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301	NC_012792	CGA	2	6	12912	12917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819997
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335	NC_012792	GCCG	2	8	13915	13922	0 %	0 %	50 %	50 %	239819998
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367	NC_012792	GCCC	2	8	15276	15283	0 %	0 %	25 %	75 %	239820000
368	NC_012792	CTTC	2	8	15303	15310	0 %	50 %	0 %	50 %	239820000
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372	NC_012792	CTCG	2	8	15480	15487	0 %	25 %	25 %	50 %	239820000
373	NC_012792	GCA	2	6	15498	15503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820000
374	NC_012792	TGC	2	6	15530	15535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239820000
375	NC_012792	CGA	3	9	15546	15554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239820000
376	NC_012792	CG	3	6	15561	15566	0 %	0 %	50 %	50 %	239820000
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384	NC_012792	CAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239820000
385	NC_012792	GC	3	6	15861	15866	0 %	0 %	50 %	50 %	239820000
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388	NC_012792	GCC	2	6	15998	16003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239820000
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